研究者如何第一時間了解生物醫學進展?已故植物學家鐘揚講過,最及時、鮮活的信息在研究者的大腦中,然后是面對面交流,其次是學術會議,最末是公開發布的文獻。那么預印本文獻應該排在什么位置?
撰文|韋玉
相比2003年的SARS疫情時期,本次新冠疫情期間,我們多了一個面向生物醫學領域的預印本平臺作為學術交流的領地。所以,我們現在可以及時地看到很多關于疫情的流行病學和基礎研究論文。據統計,在2003年SARS疫情結束時,90%的論文還在審稿當中,沒有及時發表。
隨著疫情的蔓延,不少科學家加入到新冠病的研究當中。第一時間了解全球各地科學家的工作,是科學防疫的基礎。臨床醫生、公衛管理者等防疫人員可以根據科研結論在第一時間作出快速反應。例如病的基因組序列、臨床特征、治療效果評價等等,不少進展都是先發表在了bioRxiv或medRxiv這些預印本系統上。
預印本系統的歷史
預印本,顧名思義是還未正式發表在學術期刊上的論文,一般未經同行評議之類的質量把控。公益性的預印本平臺目的在于讓學者快速發布論文,因為按照傳統的論文審稿流程,一篇論文從投稿到發布需要數周到數年之久。
拜登:我將不遺余力結束這場疫情:美國的當選總統喬·拜登發推表示:我向你保證:我將不遺余力或者作出承諾,來結束這場流行病(疫情)。[2020/12/7 14:23:52]
冷泉港的bioRxiv在2013年推出,medRxiv于2019年問世。另外,不太知名的PeerJ也在2013年面世,中科院的ChinaXiv在2017年7月推出后一直不溫不火。
對于物理、數學、社會科學領域的學者來說,預印本系統并不陌生。最早的預印本系統是1991年出現的arXiv,專門收錄這幾個領域的論文。俄羅斯天才數學家GrigoriPerelman證明“龐加萊猜想”的論文就發表在arXiv上。
觀點:受疫情影響私人投資者減少,中東歐的初創企業開始轉向公共資金:斯洛伐克區塊鏈初創公司Alftins的私人支持者因新冠疫情在3月退出融資交易時,它還有其他選擇——公共資助的風險投資公司Crowdberry。Crowdberry設法在第二輪談判中獲得更好的條款,Alftins得到所需的資金。Alftins創始人Richard Fetyko稱,這是阻力最小的途徑,Crowdberry是非常好的戰略合作伙伴。Alftins正在開發數字資產在線交易平臺。
該事件突顯出,隨著私人投資者從該地區的初創企業領域撤退,一些公共支持的風險投資公司正加緊努力,將種子資金流向波蘭、捷克、斯洛伐克和匈牙利等國家的初創企業。Crowdberry合伙人Michal Nespor稱,許多新興公司將別無選擇,只能動用這些資金,因為私人資金將因疫情而非常謹慎。
在疫情爆發前,中東歐許多初創企業更青睞私人投資者,他們通常會提供更好估值,并與硅谷等地的全球投資者建立聯系,以便日后進行更大規模融資。但隨著私人種子資金枯竭,他們越來越多轉向公共資助,因為希望跟隨波蘭在線市場Allegro、羅馬尼亞軟件公司UiPath和富時100成員Avast的腳步,打造下一個獨角獸。(路透社)[2020/7/31]
那么預印本出現之前,科學家想提及時交流成果怎么辦?通過信件或電郵——當然,電郵的出現和普及比較晚了。生活在前現代社會的列文虎克,就是通過給英國皇家學會寫信的方式,“佳作”頻傳,最終被評上皇家學會會士。
Circle首席執行官:穩定幣日常業務需求受到新冠疫情影響呈“爆炸式”增長:Circle首席執行官Jeremy Allaire在Circle轉向穩定幣后,該公司新業務模式出人意料地受到了全球新冠病危機的推動。Jeremy Allaire稱,以美元為基礎的區塊鏈代幣在全球范圍內的受歡迎程度正在飆升,而這一次的需求主要是在正常的商業交易中進行支付,而不僅僅是在加密貨幣交易所之間快速轉移資金。他表示,新注冊用戶來自電子商務市場、廣告網絡、奢侈品生產商、招聘平臺、數字內容市場、p2p借貸平臺、支付公司、軟件公司、專業服務公司、獎勵企業、移動銀行提供商和其他互聯網公司。該公司發現,在過去幾周,用于企業客戶使用USDC開展業務的Circle Business account的數量增長了700%,其中超過三分之二的業務來自加密領域之外。(Coindesk)[2020/4/17]
越來越多的出版商接受預印本系統的存在。Nature在其“Peer-reviewpolicy”中提到,作者發布預印本不影響在Nature系列期刊投稿:“作者可以隨時把自己論文發布在個人博客、維基站點或預印本平臺上。”其實早在2005年3月,Nature就曾發表題為Naturerespectspreprintservers的社論,澄清了Nature接收發布過預印本的稿件的事實。大出版商Elsevier也同意作者先發布預印本乃至學位論文,不會影響正常投稿的接收。
高盛擬設立最高100億美元“戰備”基金 以投資在疫情下急需資金的企業:美港電訊8日訊,據外媒報道,高盛集團正在尋求籌集最高100億美元的“戰備”基金,以幫助在疫情下急需資金援助的企業。高盛稱不會將“戰備”基金作為爭奪公司控制權的工具,該公司更希望將其作為債務工具,為公司克服經濟不確定提供幫助。(金十)[2020/4/8]
現在生物醫學領域的競爭尤其激烈,一些知名科學家在投稿學術期刊之前,也會先放在bioAxiv等平臺上宣示優先權,同時看看同行的反饋。另外,預印本系統與科技期刊的開放獲取運動同步,大家可以免費看到的最新科學進展越來越多。
生物醫學領域預印本系統推出得晚,主要原因不是網絡技術或利益糾葛,而是由于生物醫學領域自身的特性:獲取論文非常簡便的情況下,病人會由于缺乏專業分辨能力而誤用論文中的“粗糙”結論,從而可能傷害自身健康。和國內常見的情形類似:病人度娘了一些自認無誤的醫學認識,然后當面質疑醫生的診療結論。
當然,預印本平臺也有接收論文的標準:不能剽竊,不能有冒犯性的內容,不能是非科學或偽科學的內容,不能造成公共安全危害等。但后臺不對論文的方法論、結論和質量把關。如果大家了解論文或預印本的生產過程,那么就能夠客觀看待科學論文中的結論,知道科學進步是一個漸進的過程,科學共同體對一些問題是有共識的。
因新冠病疫情,澳本案原告方尋求將案件延期兩周:金色財經報道,澳本聰與已故Dave Kleiman的遺產糾紛案件中斷后,原告尋求將案件延長兩周。據悉,由于律師事務所暫時關閉辦事處,原告Kleiman的代表目前正在家里工作,因此Kleiman方要求延長兩周的時間以完成三名事實證人的證詞。原告請求將雙方披露專家證人摘要的聽證日期從3月27日推遲至4月10日,并將事實發現的最后期限從4月17日推遲至5月1日。[2020/3/26]
以科學家對CRISPR的認識過程為例。目前,CRISPR-Cas9基因編輯技術是非常火的領域,但一開始FancisMojica等人在細菌基因組中發現了CRISPR序列后,并不知道它的確切功能。LucianoMarraffini和ErikSontheimer提出了用CRISPR做基因編輯的設想。EmmanuelleCharpentier和JrgVogel等人發現了tracrRNA。等到JenniferDoudna、張鋒等人發明了CRISPR-Cas9系統后,這個科學故事才終于完整。我們現在回過頭去看,可以找出一個清晰的科學發現路徑,但對于不同年代的科學家來說,他們只是在各自的小領域中孜孜不倦地工作著,無法事先確立一個明確的圖景。
解讀預印本論文要小心
1998年,英國醫生AndrewWakefield在Lancet上發表了一篇論文,聲稱麻疹、風疹、流行性腮腺炎三聯疫苗能夠引發自閉癥。受此影響,接下來的十多年,英國的部分家長聽信這個說法而不再給孩子接種疫苗,使得腮腺炎在英國卷土重來。2004年,媒體記者調查發現,有疫苗官司業務的律師事務所賄賂了Wakefield,讓他“做出”疫苗有害的科學證據。
2012年,法國分子生物學家Gilles-ricSéralini發表了一篇轉基因致癌論文,其實是用致癌藥物讓大鼠長出腫瘤,然后移花接木,聲稱腫瘤是轉基因食物引起的。論文一出,媒體對轉基因的批判鋪天蓋地,歐洲的轉基因產業深受影響。歐盟不得不浪費1500萬歐元去證偽這個結果。雖然后來雜志早已撤稿,但巨大的經濟社會代價已無法挽回,反轉人士依然拿著不靠譜的結論津津樂道。
一些論文的結論往往會唬住外行,那么對于外行來說,看看論文下邊的Twitter評論也許更有幫助。預印本論文的讀者尤其容易錯誤理解論文結論,不能正確評價論文的結果,特別是論文本身存在方法缺陷和誤導性的時候。
讀者要避免把預印本中的一些結果誤讀成確定的事實。例如,近期一個牛津大學團隊發表的流行病模型提出:如果存在大量的輕癥和未測試的感染者,群體免疫是否可以實現?這與其說是一個結論,不如說是一個理論上的可能性。除非對人群進行大規模血清學測試,才可以證明群體免疫的進程,但是目前還沒有這方面的數據。
“攪拌式新聞”成為時代的信息快餐|SarahRieke繪
明智的讀者也不要相信那些洗稿或拼湊而成的“攪拌式新聞”(churnalism),這是沒有采稿能力的媒體通過東拼西湊而非原始采訪而撰寫的新聞報導。這些新聞夸大事實,給不出確鑿的證據。這里有一個基本原則可以用:無論是科學論文還是新聞,若內容太過驚人,往往是誤導性的報道。
關注某個領域一些團隊的系列研究,也是個獲取真實信息的好辦法,有較好發表記錄的科研團隊往往更可靠。不過,疫情以來,預印本系統中最先涌現的一批論文是中國的科研團隊做出的,并且是首次投稿到預印本系統。這時候普通公眾若關注某些論文,最好先讓領域內的專家先判斷下論文的水準。
預印本系統可以讓作者快速了解學界對自己工作的反饋。科學共同體也可以通過對論文進行批評、實驗驗證、繼續擴展等方式共同進步。這可以部分起到同行評議的作用:發現錯誤、評價結果解釋是否得當、要求作者補足數據或實驗。
創辦6年來,bioRxiv平臺已收錄了8萬余篇論文,其中只有不到90篇撤稿。這些撤稿論文大多是作者自己決定撤回的,比如懷疑自己的結果不可靠、作者名單有誤等問題。新冠肺炎疫情以來,有兩篇論文撤稿。一篇是印度人的工作:通過比對新冠病和HIV基因組序列,得出新冠病是人造病的結論。另外一篇是由于作者獲取了更多病人的數據,他們的結論需要修改。
參考文獻
LarryPeiperl.Preprintsinmedicalresearch:Progressandprinciples.PLoSMed.2018Apr;15(4):e1002563.
Wakefieldetal,1998,TheLancet,351,637-41.
Séralini,Gilles-Ericetal.LongtermtoxicityofaRoundupherbicideandaRoundup-tolerantgeneticallymodifiedmaize.FoodandChemicalToxicology.2012,50(11):4221–4231.(已被雜志撤稿)
JoseLourencoetal.Fundamentalprinciplesofepidemicspreadhighlighttheimmediateneedforlarge-scaleserologicalsurveystoassessthestageoftheSARS-CoV-2epidemic.MedRxiv.March26,2020.
我們梳理了比特幣誕生的前世今生,也為大家詳細講解了比特幣的發行機制。相信大家對中本聰和比特幣都會有一個相對清晰的了解了.
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